Chemomics-2021

La deuxième édition de l'école Chemomics s'est déroulée du 15 au 18 mars 2021 à Sète, France. Cette école, organisée par des membres des communautés scientifiques Metabohub (W4M) et Chemoocs /Chemhouse (Chemflow) avec le service formation permanente de l'INRAE Montpellier. Ces deux domaines d'application qui sont la métabolomique et la chimiométrie forment deux communautés différentes présentant des points communs. L’objectif de cette deuxième édition est de continuer à rapprocher ces deux communautés. Ainsi, les aspects “découverte”, “discussion” et “participation de tous” ont été au cœur de cette école basée sur le principe pédagogique du barcamp, ou non-conférence, qui prend la forme d’ateliers-événements participatifs où le contenu et les livrables sont fournis par les participants et leurs activités.

Quatre demi-journées sont consacrées chacune à un des sujets suivants, avec au moins deux animateurs par sujet :
- MB4CHEM, un outil multitableaux avec Mohamed Hanafi et Marie Tremblay-Franco
- OPLS-DA avec Mélanie Pétéra et Jean-Claude Boulet
- validation de modèles avec Benoit Jaillais et Marion Brandolini-Bunlon
- composantes temporelles avec Mohamed Hanafi et Julien Boccard

Les participants décident du programme de deux demi-journées en sélectionnant 4 thèmes parmi les suivants :
-> benchmarks pour extraction des mz-TR (features) produits en HRMS
-> data chimio VS métabo : comparaison de format
-> Workflow W4M et Chemflow, prétraitements format de données
-> tests croisés de pratiques métabo-chimio
-> benchmarks pour méthodes de normalisation de données
-> traitement sans a priori, normalisation
-> filtrage, évaluation bruits
-> sélection de variables
-> prendre du recul avec les stats ; les stats ou ? quoi ? comment ?

Suite aux conditions sanitaires, nous avons fait le choix du distanciel.

Cette école a rassemblé 76 participants doctorants, chercheurs, ingénieurs venus des instituts et des personnes d'entreprises privées.

Langue officielle: Français.