Conversions de formats de données


Pour pouvoir traiter vos spectres avec des logiciels de chimiométrie, il est nécessaire de les exporter sous un format lisible par ces logiciels.

Par exemple, le format des données utilisé dans ChemFlow est un .csv avec:
- séparateur de champ= tabulation
- séparateur décimal = point

Les données déjà au format .csv mais avec un séparateur de champ autre que la tabulation peuvent être chargées dans ChemFlow, un outil permet la conversion vers la tabulation.

Mais ce n'est pas souvent le cas. A l'origine, les données sont produites par un logiciel propriétaire. Pour devenir lisibles par d'autres logiciels, il faut les exporter dans un format d'échange standard.

Un format standard très courant est JCAMP (extension jdx ou dx) : http://www.jcamp-dx.org.

L'exportation de vos données (spectres) se fait à l'aide du logiciel spécifique à votre appareil :
Appareil = Logiciel
BRUKER = OPUS
BUCHI = NIRCAL
UNITY = Calibration Workshop (Sensologic Gmbh) â?? Ucal
PERTEN = Unscrambler (Grams)
NICOLET = Unscrambler (Grams)
Q-Interline = Grams
FOSS = Winisi

Depuis NIRCAL avec Buchi

  • 1. Ouvrir un nouveau projet
  • 2. Aller chercher les spectres acquis dans la base de données : File -> Database -> Search and Import Spectra
  • 3. Une nouvelle fenêtre s'ouvre vous permettant de sélectionner les spectres suivant certains critères : date, nom d'échantillons, etc.
  • 4. Sélectionner vos spectres puis importer les.
  • 5. Pour exporter vos spectres il est nécessaire d'exporter le projet : File -> Export -> Project (Non) -> nomduprojet.nir à l'emplacement souhaité.
  • 6. Pour exporter les spectres au format JCAMP : File -> Export -> Spectra, cliquer sur Non afin d'exporter tous les spectres du projet courant. -> NomProjet_spectre.jdx.

Depuis Winisi avec FOSS

  • 1. Une fois votre fichier enregistré au format .cal sélectionner le,
  • 2. Choisir l'onglet Files puis Convert dans le logiciel Winisi 4
  • 3. Dans une nouvelle fenêtre, sélectionner le format de sortie : JCAMP
  • 4. Sélectionner dans "Directory Files" le fichier à convertir, il s'introduit alors dans le champ "Input Filename(s)"
  • 5. Cliquer dans "Output directory" pour sélectionner le dossier qui accueillera le fichier converti, ici .jcamp.
  • 6. Puis Cliquer sur "Set Output Directory" (le "directory" associé à jcamp doit être identique à celui de l'ouput directory)
  • 7. Lancer la conversion en cliquant sur le bouton "Begin Conversion"
  • 8. Sans rien inscrire, cliquer su OK 2 fois de suite quand on vous demande l'origine et le propriétaire du fichier JCAMP.
  • 9. Un message vous annonce alors si la conversion a réussi ou non, cliquer sur Ok puis sur le bouton "Exit Program"
  • 10. Pour voir ou manipuler votre fichier JCAMP, vous rendre avec une fenêtre windows (ou Linux) dans le répertoire où vous vouliez l'enregistrez (Output directory).

Depuis TQ avec Thermofisher