ChemOmics, école mixte interdisciplinaire métabolomique et chimiométrie !

Présentation
Du 18 au 21 Novembre 2019, se tiendra à Sète CHEMOMICS , les communautés scientifiques Metabohub (W4M) et Chemoocs /Chemhouse (Chemflow) organisent avec le service formation permanente INRA Montpellier une école technique interdisciplinaire métabolomique et chimiométrie !

La métabolomique et la chimiométrie forment deux communautés différentes présentant beaucoup de points communs. L’objectif de l’école mixte est de rapprocher ces deux communautés, afin d’initier des axes de travail en commun qui se poursuivront au-delà de l’école.

Ainsi, les aspects “découverte”, “discussion” et “participation de tous” seront au cœur de cette école basée sur le principe pédagogique du "barcamp", ou non-conférence, qui prend la forme d'ateliers-événements participatifs où le contenu et les livrables sont fournis par les participants et leurs activités.

Objectifs
  • Connaître et savoir utiliser les concepts de l’autre communauté.
  • Contribuer à organiser la collaboration scientifique et technique entre chimiométriciens et spécialistes en métabolomique.
  • Être capable de produire conjointement des connaissances et des outils.

Concept
  • Format « barcamp » ou « un groupe de travail se penche sur votre question ! »
  • « Personne n’est spectateur, tous participants »
  • « Fertilisation croisée » pour mixer les communautés de chimiométrie et de métabolomique.

Qu'est-ce qu'un "barcamp" ?
Un "barcamp" est une rencontre, une non-conférence ouverte qui prend la forme d'ateliers-événements participatifs et productifs où le contenu est fourni par les participants qui doivent tous, à un titre ou à un autre, apporter quelque chose au "barcamp". C'est le principe “pas de spectateur, tous participants”. Un "barcamp" met donc l'accent sur la recherche et les innovations !

Lieu
L’école mixte “métabolomique et chimiométrie” se déroule du 18 au 22 novembre 2019 au centre de vacances Le Lazaret, Sète (34), à 30 minutes (par train / voiture) de Montpellier .

Inscription
Le tarif comprend l'inscription aux cours, keynotes et ateliers, l'hébergement et la restauration sur place, les supports de formation, mais ne comprend pas les frais de transport jusqu'au lieu de l’école.
  • Agent titulaire ou contractuel INRA, Montpellier Supagro ou Irstea : 140 €
  • Agent d'un établissement public de recherche ou d'enseignement supérieur : 420 €
  • Salarié d'une entreprise privée : 840 € attention il n’est pas possible de vous accueillir sur cette formation si les frais pédagogiques sont pris en charge dans le cadre de la formation continue de votre entreprise.

S'inscrire à l'évènement

Programme
L’école mixte est orientée vers la compréhension et l’utilisation des méthodes : sélection de variables, prétraitements, gestion des points atypiques et/ou aberrants, validation de méthodes analytiques, comparaison de méthodes analytiques, outils multi-tableaux, régressions et discriminations notamment. La formation Chemomics est organisée en journées permettant une progression de la connaissance réciproque au travail en commun. La première journée sera consacrée à des études de cas de spectrométrie : RMN, spectrométrie de masse, proche infrarouge afin de dégager les points communs mais aussi les particularités d’analyse de chaque communauté et de se les approprier. Les intervenants sont : D.Rutledge et Cécile Canlet (INRA-Metabohub) pour la RMN, JF Martin (INRA, Metabohub) et JM Roger pour la spectrométrie de masse et l’infrarouge respectivement. Les deux journées suivantes seront organisées en  BarCamp ou ateliers de travail, le thème étant choisi par les participants. Plusieurs ateliers seront menés en parallèle sur chacune des quatre demi-journées. La dernière journée permettra d’organiser des actions communes sur un plus long terme.

L’école mixte “métabolomique et chimiométrie” du 18 au 22 novembre 2019 au Lazaret (Sète) vous présente le programme prévisionnel :
  • lundi 13h30-23h
    • Introduction
    • Point commun entre la chimiométrie et la métabolomique : RMN
    • Différence entre la chimiométrie et la métabolomique : spectrométrie infrarouge et spectrométrie de masse
    • Discussion et préparation du barcamp
  • Mardi 8h30-23h
    • 1ère série d’ateliers participatifs
    • 2ème série d’ateliers participatifs
    • Key Note “Histoire des approches statistiques en métabolomique”
    • Echanges
  • Mercredi 8h30-23h
    • 3ème série d’ateliers participatifs
    • 4ème série d’ateliers participatifs
    • Key Note “Histoire de la chimiométrie”
    • Echanges
  • Jeudi 9h-12h
    • Perspectives, projets à mettre en place suite de l’école chercheurs?

Public
L’école mixte n’est pas destinée aux débutants. Les participants doivent déjà avoir une expérience théorique et pratique en métabolomique ou en chimiométrie. Si ce n’est pas le cas, ils sont vivement encouragés à suivre le mooc Chimiometrie chapitre 1/2 : les méthodes non supervisées sur FUN (https://urlz.fr/azdE), afin d’acquérir des bases en chimiométrie avant l’école mixte. Les participants seront des personnes qui se posent des questions. Ils seront avant tout motivés :
  • par la curiosité de mieux comprendre leurs pratiques et de découvrir d’autres approches.
  • de contribuer via des groupes de travail au développement conjoint de la chimiométrie et de la métabolomique.
  • de progresser dans leur quotidien.

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Deadlines
  • 14 novembre 2019 : date limite de retour des dossiers d’inscription
  • du 4 au 8 novembre 2019 : comité de sélection
  • Le comité d’organisation est susceptible de décliner certaines candidatures si le nombre de celles-ci excède les capacités d’accueil de l’école mixte ou que des prérequis n’apparaissent pas clairement.

Equipe
  • Responsables scientifiques et pédagogiques :
    • Julien Boccard, Univ Genève
    • Jean-Claude Boulet, INRA, ChemHouse
    • Binta Diémé, UCA,  MetaboHub
    • Franck Giacomoni, INRA,  MetaboHub
    • Yann Guitton, Oniris-Laberca,  MetaboHub
    • Eric Latrille, INRA, ChemHouse
    • Mélanie Pétéra, INRA, Metabohub
    • Jean-Michel Roger, IRSTEA, ChemHouse
    • Virginie Rossard, INRA, ChemHouse
    • Sylvie Roussel, Ondalys, ChemHouse
    • Robert Sabatier, Univ Montpellier
    • Marie Tremblay-Franco, INRA,  MetaboHub
    • Christophe Lebègue, INRA (Pédagogie)
  • Responsables administratifs :
    • Candie Lacroce, formation permanente INRA Montpellier
    • Sylvia Baudette, formation permanente INRA Montpellier
  • Intervenants extérieurs, conférenciers :
    • DN Rutledge, professeur émérite à  AgroParisTech, Adjunct Professor à Charles Sturt University
    • Alain Paris, professeur, CNRS- MnHN

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Lien vers: https://web.supagro.inra.fr/enquete/index.php/62587?lang=fr