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Dernière mise à jour : Mai 2018

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ChemHouse

Chemomics-2019

La première édition de l'école Chemomics s'est déroulée du 18 au 21 Novembre 2019 à Sète, France. Cette école, organisée par des membres des communautés scientifiques Metabohub (W4M) et Chemoocs /Chemhouse (Chemflow) avec le service formation permanente de l'INRA Montpellier, avait pour but de rapprocher les communautés françaises métabolomique et chimiométrie, afin d’initier des axes de travail en commun qui se poursuivraient au-delà de l’école. Ainsi, les aspects “découverte”, “discussion” et “participation de tous” ont été au cœur de cette école basée sur le principe pédagogique du barcamp, ou non-conférence, qui prend la forme d’ateliers-événements participatifs où le contenu et les livrables sont fournis par les participants et leurs activités.
Des sessions scientifiques ont présenté les points communs et les spécificités de chaque communauté :

  • « RMN : une étude de cas, sous l’angle de la métabolomique » avec Cécile Canlet (INRA Toxalim Toulouse),
  • « RMN : une étude de cas, sous l’angle de la chimiométrie » introduite par une conférence invitée de Douglas Rutledge (Agroparistech Paris),
  • « Spectrométrie de masse, sous l’angle de la métabolomique » par Jean-François Martin (INRA),
  • « Traitement des spectres proche infrarouge » avec Jean-Michel Roger (IRSTEA ITAP Montpellier - Chemhouse),
  • « Histoire et avenir de la chimiométrie » introduite par une conférence invitée de Douglas Rutledge (Agroparistech Paris),
  • « Histoire des approches statistiques en métabolomique » avec Alain Paris (MNHN - MCAM).

Puis des ateliers participatifs se sont sur deux jours autour de sujets choisis par les participants :

  • ICA, MCR, Déconvolution
  • Validation de modèle, et Robustesse : Validation
  • Multiblocs, Fusion de données
  • Filtrage, évaluation bruits
  • Sélection de variables
  • Workflow W4M et Chemflow, prétraitements format de données
  • Données manquantes NA
  • Prendre du recul avec les stats ou les stats ou ? quoi ? comment ?
  • Traitement sans a priori, Normalisation

Cette école a rassemblé 37 participants doctorants, chercheurs, ingénieurs venus des instituts et des personnes d'entreprises privées.